Уменьшение яркости образца из-за поглощения в оптической системе установки учитывают либо путем градуировки пирометра на данной установке, либо путем предварительной оценки степени поглощения (коэффициента пропускания) каждого элемента или оптической системы в целом и введения поправки в результат определения температуры. В процессе работы следует систематически проверять коэффициент пропускания системы, а также тщательно защищать ее элементы от конденсации на их поверхности паров материалов, находящихся в зоне высокой температуры. Чаще всего элементы оптической системы закрывают непрозрачными экранами, нередко со специальным охлаждением, которые отодвигают в сторону только на короткое время измерения температуры. Иногда внутри камеры рядом со смотровым окном устанавливают поворачивающийся стеклянный диск, находящийся в охлаждаемом кожухе с вырезом. Вырез в кожухе расположен против смотрового окна. Перед измерением температуры диск поворачивают так, чтобы против смотрового окна находилась незагрязненная часть диска. Газы в установку обычно вводят через отверстие около смотрового окна. Это ограничивает приближение паров к стеклу смотрового окна, уменьшая тем самым его загрязнение вследствие конденсации. Эта мера, однако, полностью не предупреждает опасности загрязнения элементов оптической системы. Нежелательным является воздействие температуры на элементы оптической системы. Из-за повышения температуры элементов оптической системы возможно помутнение стекла, изменение структуры отражающего слоя зеркала и т. п., что увеличивает степень поглощения системы.